세균 게놈 어셈블리 및 평가
이 챕터에서는 세균 게놈을 어셈블하고 평가하는 간단하지만 완전한 워크플로를 제공합니다. 이 워크플로는 페어드엔드(paired-end) Illumina 리드를 입력으로 받아 다음 작업을 수행합니다:
- megahit 어셈블러로 게놈을 어셈블합니다.
- quast로 어셈블된 게놈의 품질 보고서를 생성합니다.
- prokka로 어셈블된 게놈에 주석을 답니다.
연습 문제
어셈블러의 파라미터를 다양하게 바꿔가며 결과를 비교해 보세요 (파라미터 스윕).