Deep Learning for the Life Sciences

소개

“생명과학을 위한 딥러닝 (Deep Learning for the Life Sciences)” 의 Quarto Book 버전에 오신 것을 환영합니다.

이 책은 신약 개발, 유전체학, 의료 영상 등 생명과학 분야의 중요 문제에 딥러닝을 적용하는 실용적인 예제를 제공합니다.

책 구조

이 책의 내용은 다음과 같은 논리적 모듈로 구성되어 있습니다:

• Chapter 3: DeepChem과 머신러닝: DeepChem의 기초와 기본적인 머신러닝.
• Chapter 4: 분자를 위한 딥러닝: 그래프 합성곱 신경망(GCN)을 이용한 용해도 예측.
• Chapter 5: 딥러닝 속 생물물리학: 단백질-리간드 결합 및 구조 시각화.
• Chapter 6: 유전체학: RNA 간섭(RNAi) 및 전사 인자 결합 예측.
• Chapter 7: 현미경 영상을 위한 딥러닝: 자동 세포 계수 및 세분화(Segmentation).
• Chapter 8: 당뇨병성 망막병증 탐지: 임상 영상 분석.
• Chapter 9: 생성 모델: 데이터 생성을 위한 변분 오토인코더(VAE).
• Chapter 10: 모델 최적화 및 불확실성: 고급 훈련 기법 및 신뢰 구간 측정.
• Chapter 11: 특화된 예측 모델: ERK2 결합에 대한 사례 연구.

대화형 예제 실행

이 책은 Quarto와 Pixi 기반으로 제작되어, 저장소를 클론하면 코드 셀을 직접 실행해 볼 수 있습니다.

pixi run quarto render

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DeepChem에서 제공하는 예제들을 수정하여 작성되었습니다.